自耦變壓器在不需要初、次級隔離的場合都有應用，具有體積小、耗材少、效率高的優點。常見的交流（手動旋轉）調壓器、家用小型交流穩壓器內的變壓器、三相電機自耦減壓起動箱內的變壓器等等，都是自耦變壓器的應用范例。
自耦變壓器在運行的過程中其供電方式得到了長足的發展，在運行的過程中其由于自耦變壓器供電方式非常適用于大容量負荷的供電，對通信線路的干擾又較小，因而被客運專線以及重載貨運鐵路所廣泛采用。早期中國鐵路專用自耦變壓器主要依靠進口，成本較高且維護不便。
自耦變壓器運行方式
電力系統中常采用三繞組自耦變壓器作為聯絡變壓器，以減少投資和運行費用。它有高壓、中壓和低壓3個繞組。通常其高壓和中壓側均為110千伏以上的系統。其運行方式有以下5種。
自耦變壓器的高壓側向中壓側或者是中壓側向高壓側送電，實線方向為高壓側向中壓側送電，虛線表示中壓側向高壓側送電。因為高中低三個繞組與鐵心的相對位置，在制造時與設計有所差異，所以在這種運行方式下，如果中壓布置在高低壓之間，一般可以傳輸全部額定容量；如果中壓繞組靠鐵心布置，則由于漏磁通在結構中會引起較大的附加損耗，其較大傳輸功率s往往限制在額定容量S1n的70～80%。
自耦變壓器在運行時其高壓側向低壓側或者是低壓側向高壓側送電，在進行操作的過程中此時的功率全部通過磁路傳輸，其較大傳輸功率不得超過低壓繞組的額定容量S3n。中壓側向低壓側或低壓側向中壓側送電這種情況與第 2種運行方式相同。
中壓側同時向高壓側和低壓側或高壓側和低壓側同時向中壓側送電，在這種運行方式中，中壓繞組（即公共繞組）為原繞組，而其他兩個為副繞組。因此，較大傳輸功率受公共繞組容量的限制。
自耦變壓器在運行的過程中其霍爾傳感器都具有較強的抗外磁場干擾能力，但是，為了獲得較高的測量準確度，當有較強的磁場干擾時，要采取適當的措施來解決。
